本片將以兩兄妹在一年戰爭發生前的故事“夏亞?雪拉篇”為主軸，描述宇宙世紀0068年一個位于SIDE 3的慕佐自治共和國，該國的議長吉翁?什姆?戴肯正在發表《完全獨立宣言》的時候突然倒下暴斃。對于這場意外之死，戴肯的親信金巴·拉爾雖然公開譴責“一切都是扎比家的陰謀啦！”。但是，一心想掌握共和國實權的德金?索多?扎比不僅沒放在眼里，反而暗中率領扎比家策劃更大的陰謀。因父亡故而變成孤兒的卡斯巴爾與阿爾黛西亞，在動蕩大時代的洪流之中，即將面臨一場接一場的人生巨變……