故事講述忍者 Kamui為了逃避自己的血腥過往，脫離忍者組織，隱姓埋名地生活著。然而由于他背叛了忍者古老的信條，一天夜晚，他的家人被前組織的暗殺者殘忍殺害。為了給親人復(fù)仇，Kamui重新化身為從前的自己。然而，二十一世紀(jì)的忍者是一個(gè)時(shí)代錯(cuò)誤，因?yàn)樗麄円詺埧岫爬系募记蓪?duì)抗高科技武器。Kamui要面對(duì)訓(xùn)練有素的刺客、戰(zhàn)斗機(jī)器人以及其它強(qiáng)大的忍者，來推翻他的前組織。